工商部门对违法行为的处罚方式主要包括以下几种：
警告：
对于首次违法且情节轻微，未造成严重后果的企业，工商部门可以给予警告，要求其改正违法行为。
罚款：
罚款是最常见的行政处罚方式，根据违法情节的严重程度，罚款金额可以从几千元到几百万元不等。例如，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款；没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处二十五万元以下的罚款。
没收违法所得和非法财物：
对于违法经营所得及其相关财物，工商部门可以予以没收，以消除违法行为。
责令停产停业：
对于情节严重的违法行为，工商部门可以责令企业停产停业，以纠正违法行为并防止其继续危害社会。
暂扣或吊销许可证、执照：
对于严重违反法律法规的企业，工商部门可以暂扣或吊销其经营许可证或营业执照，剥夺其继续从事相关业务的资格。
行政拘留：
对于违法情节特别严重，构成犯罪的行为人，工商部门可以依法采取行政拘留措施。
其他行政处罚：
根据具体法律法规，还可能包括通报批评、降低资质等级、限制开展生产经营活动、责令关闭、限制从业等措施。
此外，对于被列入经营异常名录或严重违法企业名单的企业，除了上述处罚外，还可能面临其他信用惩戒措施，如限制法定代表人或负责人担任其他企业职务等。
综上所述，工商部门对违法行为的处罚方式多样，具体处罚措施会根据违法行为的性质、情节及后果等因素综合决定。企业应严格遵守相关法律法规，以免受到严厉处罚。
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