在交通信号灯为红灯时，如果存在交警指挥，车主应根据交警的手势进行通行。根据相关法律法规，这种情况下 不会被扣除驾驶证上的分数。即使被电子摄像头或电子眼拍摄，也可以凭借交警的现场指挥来进行申诉，免于处罚。
具体来说，根据《道路交通安全法》第四十四条的规定，机动车通过交叉路口时，应当按照交通信号灯、交通标志、交通标线或者交通警察的指挥通过。因此，在交警指挥下闯红灯并不属于违法行为，不会受到相应的处罚。
需要注意的是，虽然交警指挥可以免除闯红灯的处罚，但驾驶人仍需确保自己的行为符合交通规则，避免造成其他交通安全问题。若对处罚有异议，可以通过行政复议或行政诉讼等渠道进行申诉。
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