企业可以通过以下方式查询员工的毕业证：
学信网查询
本人查询：企业人力资源管理人员可以登录学信网，通过“本人查询”功能，输入员工的姓名和证书编号进行查询。需要先注册账号并登录。
零散查询：适用于查询多个证书，需要购买查询码，输入证书编号、姓名和查询码即可查询。
单位会员查询：企业可以登录学信网，选择“单位会员查询”，输入企业名称和查询码进行查询。
联系学校查询
企业可以直接联系员工毕业的学校，请求协助核实员工的学历信息。
要求员工出具学历证明
企业可以要求员工提供学历证明文件，如学士学位证书、硕士学位证书、博士学位证书等，以便进行验证。
社会认可的学历认证
企业可以要求员工通过社会认可的学历认证机构进行认证，一般需要提交学历信息和证明文件给认证机构。
第三方查询工具
如果企业有足够的资源，可以使用第三方查询工具，这些工具通常与政府教育部相关部门或认证机构联系，可以帮助企业快捷准确地查询学历。
建议企业在查询员工学历时，首选使用学信网官方渠道，因为这是最正规、最权威的方式。同时，要求员工提供学历证明文件也是一种有效的验证手段。如果需要进一步核实，可以联系员工毕业学校或通过社会认可的学历认证机构进行查询。
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